一种基于人源细胞的表面展示技术及靶向HBV受体的多肽及其应用

allin2022-09-03  126


一种基于人源细胞的表面展示技术及靶向hbv受体的多肽及其应用
技术领域
1.本发明涉及分子生物学和生物医药技术领域,具体涉及一种基于人源细胞的表面展示技术及靶向hbv受体的多肽及其应用。


背景技术:

2.包膜病毒感染细胞的过程,依赖于病毒包膜蛋白与细胞表面受体的结合。因此,干扰病毒包膜蛋白与受体的结合,可成为有效的抗病毒策略。要实现这种策略,可以封闭相应的病毒包膜蛋白,或者封闭细胞表面的相应受体,从而阻止二者的结合。能与受体相互作用,从而阻止其与病毒蛋白结合的分子,可以是化合物分子或者多肽分子。与化合物分子相比,多肽分子由氨基酸模块组成,通过改变序列和长度可以获得巨大的分子多样性。同时,多肽可以由dna编码和表达,相对容易实现低成本筛选。因此,多肽已成为一类重要的候选药物来源。
3.筛选与特定蛋白分子结合的多肽,通常可利用一些表面展示技术,比如噬菌体展示技术、酵母细胞表面展示技术,核糖体展示技术等。这些展示技术系统通常包含两种主要成分。一种是用于展示随机多肽的平台,如噬菌体,酵母细胞等;另一种是目标蛋白分子。大体筛选原理,是将目标蛋白分子固定于某种载体,然后去结合展示于噬菌体或酵母细胞表面的多肽分子。不能被结合的噬菌体或酵母细胞,将被淘筛去除。而能被结合的噬菌体或酵母细胞,则被收集下来,做进一步反复淘筛。最终获得的噬菌体或酵母细胞所表达的多肽,就可能是与目标蛋白有相当亲和力的分子。
4.然而,在筛选与病毒受体相互作用的多肽时,常用的表面展示技术可能存在困难。首先,这些多肽往往要经过某种修饰,才能发挥作用。这些修饰虽然在人体细胞中可以自动进行,但在低等生物细胞中却不能完成。例如,与hbv受体ntcp结合的多肽,需要在其n端具有豆蔻酰化修饰。其次,受体蛋白通常是膜蛋白。一方面,膜蛋白很难从原核细胞表达与纯化;另一方面,在脱离膜结构时,膜蛋白很可能不形成具有功能的正常结构,因而无法作为实际筛选靶标。


技术实现要素:

5.本发明的发明人在进行抑制乙肝病毒的多肽的研究中,发现现有的表面展示技术难以应用在所研究的课题中,针对现有表面展示技术的上述问题,开发了一种基于人源细胞的表面展示技术系统,在该表面展示技术基础上筛选到了能够抑制乙肝病毒感染的多肽。因此,本发明要求保护如下技术方案:
6.一种基于人源细胞的表面展示技术,包括如下步骤:
7.s1、将受体蛋白与荧光蛋白融合,利用sleeping beauty转座子转染hek293细胞使其稳定表达于人源细胞膜,筛选后得到该受体蛋白融合荧光蛋白的稳定表达细胞系,然后裂解细胞膜,获得含有受体-荧光蛋白融合蛋白的膜碎片备用;
8.s2、将待筛选的多肽与fasl的跨膜序列以及荧光蛋白融合,构建荧光蛋白-fasl跨膜区-多肽融合蛋白质粒,然后利用sleeping beauty转座子转染hek293细胞,经筛选后,得到的稳定表达细胞系即为细胞表面展示多肽库;
9.s3、将步骤s1得到的受体-荧光蛋白融合蛋白膜碎片与步骤s2得到的稳定表达细胞系混合孵育,然后用流式细胞仪分选与受体亲和力高的展示细胞,经过进一步的筛选富集得到与受体具有高亲和力的目标多肽;
10.所述荧光蛋白为绿色荧光蛋白或者红色荧光蛋白,且受体蛋白和多肽分别融合的是不同的荧光蛋白。
11.所述表面展示技术用于筛选与hbv受体ntcp结合的多肽;
12.步骤s1中,所述受体蛋白为ntcp,所述荧光蛋白为绿色荧光蛋白;所述裂解细胞采用的方法是反复冻融裂解破碎细胞膜,高速离心去上清后,用1ml注射器反复吹吸混匀细胞膜碎片使其基本呈现出均质状态;所述ntcp与绿色荧光蛋白由接头1连接,所述接头1的氨基酸序列为:wsgsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsv(seq id no.47);
13.步骤s2中,所述荧光蛋白为红色荧光蛋白,红色荧光蛋白cherry与fasl跨膜区之间由柔性接头2连接,所述柔性接头2的氨基酸序列为ggggs(seq id no.48);fasl跨膜区与多肽之间由柔性接头3连接,所述柔性接头3的氨基酸序列为ssgsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggs(seq id no.49);fasl跨膜区的氨基酸序列是kkrgnhstgl cllvmffmvl valvglglgm fqlfhlqke(seq id no.50)。
14.所述待筛选的多肽为将pres1 aa2-21的c端延伸7个随机氨基酸得到的随机多肽库。
15.本发明还保护由上述表面展示技术筛选得到的靶向hbv受体的多肽,所述多肽为217-3或217-4,217-3的氨基酸序列为(seq id no.51):gtnlsvpnplgffpdhqldplwtsnkk,217-4的氨基酸序列为(seq id no.52):gtnlsvpnplgffpdhqldplrrvaef。
16.所述多肽的n端有豆蔻酰化修饰。
17.蛋白质豆蔻酰化修饰(n-myristoylation)是由豆蔻酰化转移酶(n-myristoyltransferase,nmt)介导的,在蛋白质n端甘氨酸上共价连接上14-碳饱和脂肪酸。
18.本发明还保护上述的多肽在制备治疗乙型肝炎病毒的药物中的应用。
19.在上述应用技术方案中,所述多肽与hbv受体ntcp结合。
20.本发明还保护一种用于治疗乙型肝炎病毒的药物,所述药物包含上述的多肽。
21.所述药物还包含药学上可接受的载体和赋形剂,药物剂型为片剂、胶囊剂、颗粒剂、混悬剂、丸剂中的任意一种。
22.本发明的有益效果是:
23.为了解决现有技术中的展示技术系统不适合于与hbv受体ntcp(硫磺胆酸钠共转运蛋白)结合的多肽的筛选的技术问题,本发明建立了一种基于人源细胞的表面展示技术系统,以多肽pres12-21为优化起点,在其羧基末端延伸7个随机氨基酸,构建了细胞表面展示多肽库,然后利用hek293表达的ntcp-gfp融合蛋白,结合流式细胞分选以筛选对ntcp亲和力更高的多肽,通过7轮流式分选富集,二代测序结果显示,部分多肽富集程度超过1000倍。对富集程度较高的多肽逐一做流式分析,最终得到多肽217-3。与起始多肽myr21相比,
biosciences);6
×
蛋白loading、蛋白marker(bio-rad);sds-page凝胶配制试剂盒(atgene),tris、sds、nacl、cacl2(生工,上海),edta、dmso、rapamycin(solarbio,北京)。
40.2、主要材料来源
41.质粒模板来源:质粒rlucn-hbc,与中国专利申请cn 201610564291.6中的质粒rlucn-hbc相同,pch9/3091质粒由德国弗莱堡大学nassal实验室构建,pegfp-n1购自美国的clontech公司,lenticrisprv2、pspax2、pmd2.0g为麻省理工张峰实验室构建。
42.菌株:大肠杆菌dh5α购自索莱宝公司。
43.细胞:hek293购自atcc(美国模式培养物集存所),hepg2-ntcp在重庆医科大学感染性疾病分子生物学重点实验室长期保存。
44.3、本发明实施例中使用引物序列如下:
45.[0046][0047]
注:引物序列中的n代表a,g,c或t;引物序列中的k代表g或t。
[0048]
4、本发明技术方案的总体技术方案设计
[0049]
我们以hbv pres1蛋白(乙型肝炎病毒前s1蛋白)的第2-21位氨基酸(pres1 aa2-21)序列为筛选和优化起点,因为pres1 aa2-21是参与pres1与hbv受体ntcp结合的重要序列。技术方案需要满足以下几项条件:(1)多肽序列的n端需要被豆蔻酰化,才具有与ntcp的结合能力;为此,我们利用人源细胞hek293表达这些多肽,以获得豆蔻酰化修饰;(2)待筛选的多肽具有序列多样性,为此,我们将pres1 aa2-21的c端延长7个随机氨基酸,以获得这种多样性(图1a);(3)这些多肽需要被展示在细胞膜表面,为此,我们将多肽与fasl(fasl长278aa,为ii型跨膜糖蛋白,由胞膜外区、跨膜区和胞浆区组成)的跨膜序列融合,以实现其在细胞膜表面的展示(图1a);(4)这些多肽需要被带上荧光标记以便分选,为此,我们将多肽融合红色荧光蛋白cherry(图1a);(5)这些多肽还需要从hek293细胞中稳定表达,以获得亲和表型与基因型的偶联;为此,我们利用sleeping beauty转座子,来构建随机多肽的稳定表达混合细胞系;(6)需要表达结构和功能正常的靶蛋白ntcp,同时ntcp也需要被荧光标记以便筛选;为此,我们利用hek293细胞表达融合蛋白ntcp-gfp,该融合蛋白将被表达于细胞膜上,我们将用反复冻融方式破碎细胞膜,然后,以位于细胞膜碎片上的ntcp-gfp作为筛选靶分子。
[0050]
整体筛选流程如下:首先,利用转座子构建稳定表达多样性多肽的融合蛋白,将多
肽展示在hek293细胞表面(图1b);然后,将带有ntcp-gfp的细胞膜碎片与展示了多肽的hek293细胞孵育(图1c);孵育的结果,是那些与ntcp亲和力较高的展示细胞,吸附更多的ntcp-gfp分子。将这些细胞悬混液用流式细胞仪分选(图1d),选择那些表达cherry并且gfp信号较高的细胞,做进一步培养扩增(图1e);再用经过扩增的细胞,与ntcp-gfp孵育后做下一轮筛选富集。如此反复分选富集数轮以后,提取细胞的基因组dna并用pcr扩增含有多样性多肽的区段,做二代测序,以鉴定其序列。选择那些丰度较高且富集程度较高的序列做进一步鉴定(图1f),其中部分序列可能与ntcp有较高亲和力,因而具有进一步研究开发价值。
[0051]
实施例1质粒构建
[0052]
质粒gfp-frb,frb-gfp,cherry-fasl-fkbp,ntcp-gfp为前期构建,在此基础上构建其它质粒。
[0053]
质粒gfp-frb是以rlucn-hbc为骨架,将绿色荧光蛋白gfp基因插入在cmv启动子和sv40终止子之间的表达框内得到的质粒,其中gfp位于n端,frb位于c端。
[0054]
质粒frb-gfp是以rlucn-hbc为骨架,将绿色荧光蛋白gfp基因插入在cmv启动子和sv40终止子之间的表达框内得到的质粒,其中frb位于n端,gfp位于c端。
[0055]
质粒cherry-fasl-fkbp是以rlucn-hbc为骨架,将红色荧光蛋白-fasl-fkbp融合基因插入在cmv启动子和sv40终止子之间的表达框内之间得到的质粒。
[0056]
质粒ntcp-gfp以rlucn-hbc为骨架,将ntcp-gfb融合基因插入在cmv启动子和sv40终止子之间的表达框内得到的质粒。
[0057]
一、构建中间质粒lenti-ntcp-gfp-2a-blast,ntcp d157-165-gfp,ntcp-cherry,lenti-ntcp-cherry-2a-blast,ntcp 267s/f-cherry,ntcp d157-165-cherry,pres-d11-15-gfp
[0058]
其中,lenti-ntcp-gfp-2a-blast和lenti-ntcp-cherry-2a-blast用于构建稳定系,分别为ntcp-gfp和ntcp-cherry的稳定系,方便随取随用。
[0059]
pres-d11-15-gfp的构建,是以pres1 48为模板,用引物f d11-15+r d11-15扩出片段,该片段自连即可得到该质粒。
[0060]
以ntcp-gfp为模板,用引物fen-cmv+regfp扩增得到片段1。再以lenti-cas9-blast质粒(商购)为模板,用引物f lentiv2 p2a+r lenti preef-1α得到片段2。利用golden gate克隆法将片段1、2酶切连接得到质粒lenti-ntcp-gfp-blast。
[0061]
以ntcp-gfp为模板,用引物r de157-165+famp494 ggtt,f de157-165+ramp494 aacc扩增得到片段3、4,利用golden gate克隆法将片段3、4酶切连接得到质粒ntcp d157-165-gfp。
[0062]
以ntcp-gfp为模板,用引物f sv40 gg2+r gsntcp扩得片段5。以带有红色荧光蛋白基因cherry基因的质粒为模板,用fagca cherry+r gtta cherry扩出片段6。片段5、6酶切连接得到质粒ntcp-cherry。
[0063]
质粒ntcp-cherry构建完成后,以之为模板,f ttac267+ramp494 aacc,r gtaa267+famp494 ggtt扩增得到片段7、8,用引物r de157-165+famp494 ggtt,f de157-165+ramp494 aacc扩增得到片段9、10,利用golden gate克隆法将片段7、8酶切连接得到质粒ntcp 267s/f-cherry,片段9、10酶切连接得到质粒ntcp d157-165-cherry。
[0064]
pcr扩增反应体系为:作为模板的质粒10ng,正向引物f(10μm)/反向引物r(10μm)
各0.4μl,2
×
primestar max premix(takara)10μl,灭菌超纯水补齐体积至20μl。反应条件:95℃预变性3min;98℃10s,55℃5s,72℃30s,36个循环。用胶回收试剂盒回收扩增片段。
[0065]
golden gate连接反应的反应体系为:bsmb iv2酶(neb)0.75μl、tango buffer 1μl、dtt 1μl、t7 dna ligase(neb)0.25μl、atp 1μl、待连接的各片段。各片段按照kb*20/gel回收的浓度(ng/μl)来计算加入的量,ddh2o补齐至10μl。反应条件:42℃5min,16℃5min,循环25次后,60℃5min。golden gate产物转化dh5α感受态细菌,涂板,克隆初筛,测序鉴定成功后提小抽,即可得到目标质粒。
[0066]
二、构建质粒pt4-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast(pt4-48),pt4-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast(pt4-21)
[0067]
以cherry-fasl-fkbp为模板,用引物r gsfasl+f sv40 gg2扩增得到片段11,以pch9/3091为模板,f pres1+r gtta pres48扩增得到片段12,片段11、12酶切连接得到质粒cherry-fasl-pres1 48。
[0068]
pt4-48和pt4-21的构建分为以下两步:
[0069]
第一步,在cherry-fasl-pres1 48的基础上构建lenti-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast,lenti-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast。
[0070]
以lenti-cas9-blast为模板,用引物f lentiv2 p2a+famp494 ggtt,r lentipreef-1α+ramp494 aacc分别扩出片段13、14,以cherry-fasl-pres1 48为模板,用引物fen-cmv+r atcc pres48,fen-cmv+r atcc pres21,分别扩出片段15、16。片段13、14、15酶切连接得到质粒lenti-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast,片段13、14、16酶切连接得到质粒lenti-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast。
[0071]
第二步,在lenti-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast,lenti-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast的基础上构建pt4-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast(简称pt4-48),pt4-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast(简称pt4-21)。
[0072]
以lenti-cherry-fasl-pres1 48-2a-blast为模板,用引物f atgg cherry-2+r blast-2扩出片段17;以lenti-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast为模板,用引物f atgg cherry-2+r blast-2扩出片段18;以pt4/hb(商购)为模板,用引物f pt4 rir-2+r cmv ccat扩出片段19。片段17、19连接得到质粒pt4-48,片段18、19连接得到质粒pt4-21。
[0073]
pcr反应体系和goldengate连接反应的体系同上。
[0074]
至此,pt4-48及pt4-21构建完成,pt4-48用于后续ntcp-pres1系统验证流式分选富集的可行性实验中比较pt4-21与pt4-48对于ntcp-gfp结合力的强弱,表明该系统理论上能够筛选出结合力更强的突变体。
[0075]
三、构建pt4-21+7随机多肽库
[0076]
之前的研究显示,n-肉豆蔻酰化修饰的pres1 aa2-21是pres1与其受体结合的高度保守区域。因此,我们在pres1 aa2-21的基础上,向c端延伸7个随机氨基酸构建随机多肽库。
[0077]
采用传统nnk法,构建21+7随机多肽库,即在pt4-cherry-fasl-pres1 21-2a-blast(pt4-21)的基础上构建了pt4-cherry-fasl-pres1 21+7随机多肽库(用pt4-21+7简写表示),过程如下:
[0078]
以pt4-21为模板,用引物f1-nnk7tcca’21+r1-pres21tgga扩得一个大约5kb的片
段,取100ng做goldengate单一片段自连。goldengate连接重复15管,共获取150μl的连接产物体系。转化后不涂板,直接将转化产物加入lb培养基中,37℃,220rpm摇1h以复苏,加入氨苄青霉素至100μg/ml,继续摇12h,提中抽,即得到质粒pt4-21+7随机多肽库。pcr反应体系同上。
[0079]
golden gate连接反应的反应体系为:bsmb iv2酶0.75μl、tango buffer 1μl、dtt 1μl、t7 dna ligase 0.25μl、atp 1μl、自连片段100ng,ddh2o补齐至10μl。反应条件:42℃5min,16℃5min,循环30次后,60℃5min。golden gate产物转化dh5α感受态细菌,涂板,克隆初筛,测序鉴定成功后提小抽,即可得到目标质粒,即为多肽库。多肽库构建完成后,用pt4/sb100x转座子系统转染hek293细胞,转染步骤按试剂操作说明书进行。经blasticidin筛选两周后,得到的稳定表达细胞系即为细胞表面展示多肽库。
[0080]
图6是随机延伸多肽库的一代测序结果。
[0081]
四、frb-gfp的基础上构建质粒pres1 48-gfp,pres1 21-gfp,以及筛选得到的10个突变体217-1~10-gfp
[0082]
以质粒frb-gfp为模板,用引物r bsmbi vect+f gsgfp扩出片段20;以cherry-fasl-pres1 48为模板,用f catg pres1+rpres 48扩出片段21。片段20、21连接得到质粒pres1 48-gfp。
[0083]
以pres1 48-gfp为模板,用引物r pres 20+famp494 ggtt,f pres 20+ramp494 aacc,分别扩出片段22、23,连接片段22、23得到质粒pres1 21-gfp。
[0084]
根据实施例2中筛选得到的10条候选序列(217-1——217-10)构建质粒突变体217-1~10-gfp用于后续实验:
[0085]
以pres1 21-gfp为模板,用引物racga217-1-gfp+famp494 ggtt,racga217-2-gfp+famp494 ggtt,racga217-3-gfp+famp494 ggtt,racga217-4-gfp+famp494 ggtt,racga217-5-gfp+famp494 ggtt,racga217-6-gfp+famp494 ggtt,racga217-7-gfp+famp494 ggtt,racga217-8-gfp+famp494 ggtt,racga217-9-gfp+famp494 ggtt,racga217-10-gfp+famp494 ggtt,ftcgt-gfp+ramp494 aacc分别扩出1个片段,依次命名为片段24
‑‑
34,其中,片段24-33分别与片段34连接可得到以下10个质粒突变体,依次为:1-krridqy,2-yilmdim,3-lwtsnkk,4-lrrvaef,5-rnkdchl,6-mgdvrsg,7-yvplmka,8-lylpiqm,9-hrdlral,10-ptlcfpg。
[0086]
pcr反应体系及goldengate连接反应同前面步骤一。
[0087]
实施例2流式分选富集可行性验证
[0088]
一、利用fkbp12-frb系统验证流式分选富集的可行性
[0089]
建立本发明技术方案中的筛选系统的关键之一,在于能够用流式细胞仪进行分选与富集,将那些能够结合ntcp的多肽展示细胞分离出来。为了验证这种流式分选方式的可行性,我们首先用雷帕霉素调控fkbp12-frb相互作用系统来进行模拟测试。
[0090]
将质粒gfp-frb转染hek293细胞,转染48小时后,用胰酶消化收集细胞并用pbs重悬,然后将细胞用液氮及37℃水浴反复冻融裂解细胞。离心去除裂解后的细胞碎片,获得含有融合蛋白gfp-frb的上清备用。将质粒cherry-fasl-fkbp转染hek293细胞,转染48小时后,消化收集细胞,并用pbs重悬。取细胞悬液2份,分别与前述含有gfp-frb的裂解液37℃孵育1小时。其中1份在孵育前加入雷帕霉素(rapamycin),另一份不做处理作为对照。随后,用
流式细胞仪分析两份样品。分析结果如图2所示,在未加入雷帕霉素时,那些能表达cherry的细胞呈现红色荧光(红色线条),但所有细胞均不呈现明显的绿色荧光。加入雷帕霉素的样品中,可见部分表达cherry的细胞同时也呈现明显较高水平的绿色荧光,表示这些细胞表面的fkbp在雷帕霉素辅助下,的确结合了gfp-frb。由于这群细胞与未结合gfp-frb的细胞有明显差异,因此可以由流式细胞分选出来。
[0091]
二、利用ntcp-pres1系统验证流式分选富集的可行性
[0092]
我们进一步验证了本发明的细胞表面展示技术能否用于pres1/ntcp相互作用检测。验证实验分为两个方面:
[0093]
(1)验证表达于膜上的ntcp-cherry蛋白能否与表达于胞浆的gfp-pres1蛋白(裂解细胞后)相互作用:采用反复冻融裂解高速离心取上清获得表达于胞浆的gfp-pres1蛋白。采用质粒ntcp-cherry转染hek293细胞,转染48小时后,消化收集细胞,并用pbs重悬。取细胞悬液与前述含有gfp-pres1的裂解液37℃孵育1小时。随后,用流式细胞仪分析样品。实验时同时采用ntcp、pres1进行缺失突变或点突变的融合蛋白质粒(前面构建的ntcp d157-165-cherry、ntcp 267s/f-cherry)作为对照转染hek293细胞获得缺失突变或点突变的ntcp-cherry、gfp-pres1。
[0094]
实验结果如图3所示,野生型ntcp-cherry与野生型gfp-pres1之间可检测到明显的相互作用,而将ntcp或者pres1进行缺失突变或点突变时,这种相互作用消失,与预期的结果一致。图3中,ntcp 267s/f-cherry是指ntcp第267位氨基酸点突变后与红色荧光蛋白的融合蛋白,ntcp d157-165-cherry是指ntcp第157-165位氨基酸缺失突变后与红色荧光蛋白的融合蛋白,pres1-d11-15-gfp是指pres1的第11-15位氨基酸缺失突变后与绿色荧光蛋白的融合蛋白。
[0095]
(2)参照(1)的方法,我们还验证了表达于膜上的cherry-fasl-pres1蛋白能否与表达于膜上的ntcp-gfp蛋白(反复冻融裂解成细胞膜碎片)相互作用。实验结果如图4所示,流式分析可检测到野生型ntcp-gfp与cherry-fasl-pres1之间的相互作用。当ntcp突变后(ntcp d157-165-gfp),两分子间亲和力基本丧失。同时,pres1 48对ntcp-gfp的结合量明显高于pres1 21。这些结果均与预期一致。图4中,ntcp d157-165-gfp表示ntcp第157-165位氨基酸缺失突变后与绿色荧光蛋白的融合蛋白。
[0096]
三、利用ntcp-pres1系统进行浓度梯度结合试验
[0097]
为了证明该系统能反映蛋白结合量的多寡,我们又进行了浓度梯度结合试验。如图5所示,随着ntcp-gfp量的增加,细胞表面会结合更多ntcp-gfp膜蛋白。在此基础上,用竞争抑制试验来测试这种结合是否具有特异性,即在ntcp-gfp与细胞表面展示了pres1的细胞共孵育之前,用myr21(即豆蔻酰化修饰的pres1 21)多肽预处理ntcp-gfp,以封闭一部分ntcp。与此同时,用一个无关多肽处理ntcp-gfp及一个不作任何处理的ntcp-gfp样本作为对照。结果表明,无关多肽处理和不作处理结果相当,而myr21处理组的结合率下降。说明这种结合具有特异性,同时表明该系统可以分辨结合了不同量ntcp-gfp的情况,可以用于后续筛选。
[0098]
四、多肽库的筛选与验证
[0099]
将实施例1中得到的展示了随机多肽pt4-21+7的稳定表达细胞与ntcp-gfp膜蛋白(含有该融合蛋白的细胞膜碎片)以4:1的细胞数量比例共孵育2小时后,采用ntcp-pres1系
统,用流式细胞术分选出膜蛋白结合量最高5%的细胞,分选出来的细胞经过扩大培养以后,再次分选,如此反复分选富集7轮。对第5轮和第7轮富集扩增的细胞,提取基因组dna,并用pcr扩增(扩增引物对为f-21/r-21)包含多肽序列的片段,pcr反应程序是:95℃预变性3min;98℃10s,55℃5s,72℃10s,28个循环。胶回收纯化片段后做二代测序,并将该测序结果与初始多肽库的二代测序结果进行比较。测序结果显示,初始多肽库的多样性大于30万种,而经过5轮和7轮富集后,多样性明显减少到7万种左右(图7)。我们选择同时满足以下两种条件的第7轮富集序列:(1)二代测序中序列占比位列前10;(2)与初始多肽库相比,富集倍数(某序列在富集库的占比/在初始库中的占比)位列前10。
[0100]
依上述标准,总共得到10条候选序列,分别命名为217-1——217-10,如图8所示。这些序列的占比最高接近10%,富集倍数均大于1万倍。我们对这10条序列进行了进一步验证。验证方式与初筛方式有所不同,我们将ntcp-cherry直接展示于细胞表面,而将融合了gfp的pres1多肽从胞浆表达,因为这种方式更接近病毒感染时的状况。为确定此种方式的有效性,我们用融合蛋白gfp-frb(阴性对照)及pres1 21-gfp、pres1 48-gfp进行验证,结果如图9所示,与阴性对照相比,流式分析显示pres1 48和pres1 21均与ntcp-cherry存在明显结合,且pres1 48的结合强于pres1 21。这一结果表明,这种方式能很好地反映不同多肽与ntcp的亲和力差异。
[0101]
217-1——217-10、pres1 21、pres1 48、的氨基酸序列分别如下:
[0102]
pres1 21(即多肽pres1的第2-21位氨基酸)的氨基酸序列为(seq id no.53):gtnlsvpnplgffpdhqldp。
[0103]
pres1 48(即多肽pres1的第2-48位氨基酸)的氨基酸序列为(seq id no.54):gtnlsvpnplgffpdhqldpafrantanpdwdfnpnkdtwpdankvg。
[0104]
217-1——217-10的氨基酸序列为在pres2-21的基础上分别添加以下七个氨基酸:
[0105]
1-krridqy,2-yilmdim,3-lwtsnkk,4-lrrvaef,5-rnkdchl,6-mgdvrsg,7-yvplmka,8-lylpiqm、9-hrdlral,10-ptlcfpg。
[0106]
217-1——217-10的氨基酸序列依次如序列表中seq id no.55、56、51、52、57~62所示。
[0107]
我们将前述10条序列分别构建到pres1 21-gfp质粒框架中(在pres1-21的c端分别加上这些多肽序列,即实施例1中构建得到的质粒突变体217-1~10-gfp),然后将10种质粒分别转染hek293细胞。48小时后收集细胞,反复冻融裂解后离心取上清。western blot检测显示,各上清样本中目标蛋白表达量相似(图9)。将这些上清分别与表达ntcp-cherry的稳定细胞共孵育2小时,然后进行流式细胞仪检测分析。结果显示,发现序列217-3、217-4在原pres1 21的基础上对ntcp膜蛋白的亲和力有显著提高,接近pres 148的结合水平(图9)。
[0108]
实施例3、在hepg2-ntcp细胞模型中验证myr-217-3的抗hbv感染作用
[0109]
体外合成实施例2筛选出的多肽217-3(n端豆蔻酰化修饰),以及作为对照的多肽myr21。用不同浓度梯度的多肽预处理hepg2-ntcp 2小时,再感染乙肝病毒。每2天换液,到第七天时同时检测细胞培养上清中的hbeag和hbsag。结果显示(图10),myr-217-3(n端豆蔻酰化修饰的多肽217-3)抑制hbv感染的ic50较myr-21改进了约8倍。

技术特征:
1.一种基于人源细胞的表面展示技术,其特征在于,包括如下步骤:s1、将受体蛋白与荧光蛋白融合,利用sleepingbeauty转座子转染hek293细胞使其稳定表达于人源细胞膜,筛选后得到该受体蛋白融合荧光蛋白的稳定表达细胞系,然后裂解细胞膜,获得含有受体-荧光蛋白融合蛋白的膜碎片备用;s2、将待筛选的多肽与fasl的跨膜序列以及荧光蛋白融合,构建荧光蛋白-fasl跨膜区-多肽融合蛋白质粒,然后利用sleepingbeauty转座子转染hek293细胞,经筛选后,得到的稳定表达细胞系即为细胞表面展示多肽库;s3、将步骤s1得到的受体-荧光蛋白融合蛋白膜碎片与步骤s2得到的稳定表达细胞系混合孵育,然后用流式细胞仪分选与受体亲和力高的展示细胞,经过进一步的筛选富集得到与受体具有高亲和力的目标多肽;所述荧光蛋白为绿色荧光蛋白或者红色荧光蛋白,且受体蛋白和多肽分别融合的是不同的荧光蛋白。2.如权利要求1所述的表面展示技术,其特征在于:所述表面展示技术用于筛选与hbv受体ntcp结合的多肽;步骤s1中,所述受体蛋白为ntcp,所述荧光蛋白为绿色荧光蛋白;所述裂解细胞采用的方法是反复冻融裂解破碎细胞膜;所述ntcp与绿色荧光蛋白由接头1连接,所述接头1的氨基酸序列为:wsgsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsv;步骤s2中,所述荧光蛋白为红色荧光蛋白,红色荧光蛋白cherry与fasl跨膜区之间由柔性接头2连接,所述柔性接头2的氨基酸序列为ggggs;fasl跨膜区与多肽之间由柔性接头3连接,所述柔性接头3的氨基酸序列为ssgsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggsg gggsggggs;fasl跨膜区的氨基酸序列是kkrgnhstgl cllvmffmvl valvglglgm fqlfhlqke。3.如权利要求2所述的表面展示技术,其特征在于:所述待筛选的多肽为将pres1 aa2-21的c端延伸7个随机氨基酸得到的随机多肽库。4.一种靶向hbv受体的多肽,其特征在于:所述多肽为217-3或217-4,217-3的氨基酸序列为:gtnlsvpnplgffpdhqldplwtsnkk,217-4的氨基酸序列为:gtnlsvpnplgffpdhqldplrrvaef。5.如权利要求4所述的多肽,其特征在于:所述多肽的n端有豆蔻酰化修饰。6.权利要求4或5所述的多肽在制备治疗乙型肝炎病毒的药物中的应用。7.如权利要求6所述的应用,其特征在于:所述多肽与hbv受体ntcp结合。8.一种用于治疗乙型肝炎病毒的药物,其特征在于:所述药物包含权利要求4或5所述的多肽。9.如权利要求8所述的药物,其特征在于:所述药物还包含药学上可接受的载体和赋形剂,药物剂型为片剂、胶囊剂、颗粒剂、混悬剂、丸剂中的任意一种。

技术总结
本发明公开了一种基于人源细胞的表面展示技术,包括:S1、将受体蛋白与荧光蛋白融合,获得含有受体-荧光蛋白融合蛋白的膜碎片备用;S2、将待筛选的多肽与FasL的跨膜序列以及荧光蛋白融合,构建荧光蛋白-FasL跨膜区-多肽融合蛋白质粒,得到的稳定表达细胞系为细胞表面展示多肽库;S3、将受体-荧光蛋白融合蛋白膜碎片与步骤S2得到的稳定表达细胞系混合孵育,然后用流式细胞仪分选与受体亲和力高的展示细胞,筛选富集得到与受体具有高亲和力的目标多肽;本发明还公开了靶向HBV受体的多肽217-3或217-4,经实验证实,Myr-217-3抑制HBV感染的IC50较Myr-21改进了约8倍。21改进了约8倍。21改进了约8倍。


技术研发人员:胡接力 王珮耘 黄爱龙
受保护的技术使用者:重庆医科大学
技术研发日:2022.03.22
技术公布日:2022/7/5
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